MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus haemolyticus JCSC1435 chromosome

Total Repeats: 54505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007168	TTTAT	2	10	500	509	20 %	80 %	0 %	0 %	70725002
2	NC_007168	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
3	NC_007168	T	6	6	582	587	0 %	100 %	0 %	0 %	70725002
4	NC_007168	ATC	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
5	NC_007168	AAG	2	6	680	685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
6	NC_007168	CTG	2	6	743	748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
7	NC_007168	TGA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725002
8	NC_007168	TCAAT	2	10	843	852	40 %	40 %	0 %	20 %	70725002
9	NC_007168	GCA	2	6	907	912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725002
10	NC_007168	TA	3	6	960	965	50 %	50 %	0 %	0 %	70725002
11	NC_007168	TGG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
12	NC_007168	ATGC	2	8	997	1004	25 %	25 %	25 %	25 %	70725002
13	NC_007168	TCA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
14	NC_007168	TA	3	6	1049	1054	50 %	50 %	0 %	0 %	70725002
15	NC_007168	TCA	2	6	1082	1087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
16	NC_007168	TGAT	2	8	1151	1158	25 %	50 %	25 %	0 %	70725002
17	NC_007168	AAG	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
18	NC_007168	TTC	2	6	1201	1206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
19	NC_007168	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
20	NC_007168	AGA	2	6	1287	1292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
21	NC_007168	CTC	2	6	1337	1342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70725002
22	NC_007168	TTC	2	6	1367	1372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725002
23	NC_007168	A	7	7	1375	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
24	NC_007168	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
25	NC_007168	CTG	2	6	1406	1411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725002
26	NC_007168	TCAA	2	8	1440	1447	50 %	25 %	0 %	25 %	70725002
27	NC_007168	TTGC	2	8	1480	1487	0 %	50 %	25 %	25 %	70725002
28	NC_007168	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725002
29	NC_007168	A	7	7	1570	1576	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
30	NC_007168	ACT	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725002
31	NC_007168	A	7	7	1644	1650	100 %	0 %	0 %	0 %	70725002
32	NC_007168	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
33	NC_007168	GGT	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725002
34	NC_007168	AAG	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725002
35	NC_007168	CAAT	2	8	1854	1861	50 %	25 %	0 %	25 %	70725002
36	NC_007168	ATG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
37	NC_007168	AGA	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
38	NC_007168	ATT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
39	NC_007168	TTA	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
40	NC_007168	AAC	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
41	NC_007168	TTC	2	6	2407	2412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
42	NC_007168	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
43	NC_007168	A	6	6	2425	2430	100 %	0 %	0 %	0 %	70725003
44	NC_007168	CAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
45	NC_007168	TAC	2	6	2540	2545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
46	NC_007168	TGA	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
47	NC_007168	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	70725003
48	NC_007168	CAAA	2	8	2608	2615	75 %	0 %	0 %	25 %	70725003
49	NC_007168	TACT	2	8	2648	2655	25 %	50 %	0 %	25 %	70725003
50	NC_007168	AGA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
51	NC_007168	TCA	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
52	NC_007168	TAAA	2	8	2795	2802	75 %	25 %	0 %	0 %	70725003
53	NC_007168	TTTA	2	8	2856	2863	25 %	75 %	0 %	0 %	70725003
54	NC_007168	TTA	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
55	NC_007168	ACA	2	6	2917	2922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
56	NC_007168	AAATT	2	10	2945	2954	60 %	40 %	0 %	0 %	70725003
57	NC_007168	ATCG	2	8	2986	2993	25 %	25 %	25 %	25 %	70725003
58	NC_007168	CTT	2	6	2996	3001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725003
59	NC_007168	CAA	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725003
60	NC_007168	TTA	2	6	3029	3034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725003
61	NC_007168	ATG	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
62	NC_007168	ATC	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725003
63	NC_007168	AGA	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
64	NC_007168	TTTC	2	8	3143	3150	0 %	75 %	0 %	25 %	70725003
65	NC_007168	ATG	2	6	3163	3168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
66	NC_007168	ATG	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
67	NC_007168	AAGTTG	2	12	3197	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725003
68	NC_007168	AGA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725003
69	NC_007168	AATT	2	8	3269	3276	50 %	50 %	0 %	0 %	70725003
70	NC_007168	AAG	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725004
71	NC_007168	TAG	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725004
72	NC_007168	ATT	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
73	NC_007168	TAAT	2	8	3791	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	70725004
74	NC_007168	A	6	6	3823	3828	100 %	0 %	0 %	0 %	70725004
75	NC_007168	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725004
76	NC_007168	GAA	2	6	3948	3953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
77	NC_007168	A	6	6	4170	4175	100 %	0 %	0 %	0 %	70725005
78	NC_007168	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
79	NC_007168	AGA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725005
80	NC_007168	CAA	2	6	4452	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
81	NC_007168	TCA	2	6	4501	4506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725005
82	NC_007168	GA	4	8	4554	4561	50 %	0 %	50 %	0 %	70725005
83	NC_007168	GAT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
84	NC_007168	GCA	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725005
85	NC_007168	TTA	2	6	4845	4850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725005
86	NC_007168	GAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
87	NC_007168	GAT	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725005
88	NC_007168	AAC	3	9	4934	4942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725005
89	NC_007168	AAT	2	6	4974	4979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725005
90	NC_007168	AATC	2	8	4994	5001	50 %	25 %	0 %	25 %	70725005
91	NC_007168	ACA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
92	NC_007168	GTAT	2	8	5128	5135	25 %	50 %	25 %	0 %	70725006
93	NC_007168	CAC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	70725006
94	NC_007168	CGA	2	6	5198	5203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
95	NC_007168	CAAAT	2	10	5221	5230	60 %	20 %	0 %	20 %	70725006
96	NC_007168	TTA	2	6	5236	5241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
97	NC_007168	A	6	6	5305	5310	100 %	0 %	0 %	0 %	70725006
98	NC_007168	GTC	2	6	5314	5319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
99	NC_007168	CAG	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
100	NC_007168	TGG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
101	NC_007168	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	70725006
102	NC_007168	GGT	2	6	5391	5396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
103	NC_007168	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
104	NC_007168	GTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725006
105	NC_007168	CTAT	2	8	5470	5477	25 %	50 %	0 %	25 %	70725006
106	NC_007168	A	6	6	5490	5495	100 %	0 %	0 %	0 %	70725006
107	NC_007168	GTAG	2	8	5523	5530	25 %	25 %	50 %	0 %	70725006
108	NC_007168	AAC	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
109	NC_007168	AG	3	6	5628	5633	50 %	0 %	50 %	0 %	70725006
110	NC_007168	GAA	2	6	5775	5780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
111	NC_007168	TCA	2	6	5792	5797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725006
112	NC_007168	GAT	2	6	5805	5810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
113	NC_007168	TAGAAA	2	12	5812	5823	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	70725006
114	NC_007168	CAA	2	6	5851	5856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725006
115	NC_007168	TTA	2	6	5859	5864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
116	NC_007168	AAT	2	6	5874	5879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725006
117	NC_007168	GGT	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
118	NC_007168	ATT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
119	NC_007168	AAAG	2	8	5982	5989	75 %	0 %	25 %	0 %	70725006
120	NC_007168	CGT	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
121	NC_007168	TTG	2	6	6106	6111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725006
122	NC_007168	CACGTG	2	12	6199	6210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	70725006
123	NC_007168	GCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725006
124	NC_007168	CGT	2	6	6240	6245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725006
125	NC_007168	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
126	NC_007168	TAG	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
127	NC_007168	AAG	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
128	NC_007168	AAT	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725006
129	NC_007168	TGG	2	6	6497	6502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725006
130	NC_007168	GC	3	6	6568	6573	0 %	0 %	50 %	50 %	70725006
131	NC_007168	TTA	2	6	6585	6590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725006
132	NC_007168	TTC	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725006
133	NC_007168	CAAA	2	8	6680	6687	75 %	0 %	0 %	25 %	70725006
134	NC_007168	AATG	2	8	6785	6792	50 %	25 %	25 %	0 %	70725006
135	NC_007168	ATG	2	6	6834	6839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725006
136	NC_007168	AGA	2	6	6854	6859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725006
137	NC_007168	TCAA	2	8	7077	7084	50 %	25 %	0 %	25 %	70725007
138	NC_007168	CGT	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
139	NC_007168	A	6	6	7255	7260	100 %	0 %	0 %	0 %	70725007
140	NC_007168	ATG	2	6	7322	7327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
141	NC_007168	GTTATC	2	12	7355	7366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	70725007
142	NC_007168	ATG	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
143	NC_007168	AG	3	6	7525	7530	50 %	0 %	50 %	0 %	70725007
144	NC_007168	TTA	2	6	7561	7566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725007
145	NC_007168	CAA	2	6	7601	7606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725007
146	NC_007168	TCC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	70725007
147	NC_007168	TCA	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725007
148	NC_007168	TAAG	2	8	7655	7662	50 %	25 %	25 %	0 %	70725007
149	NC_007168	TAA	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725007
150	NC_007168	GAAAA	2	10	7909	7918	80 %	0 %	20 %	0 %	70725007
151	NC_007168	TGA	2	6	7941	7946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
152	NC_007168	AGT	2	6	7971	7976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
153	NC_007168	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	70725007
154	NC_007168	CGT	3	9	8152	8160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
155	NC_007168	A	6	6	8176	8181	100 %	0 %	0 %	0 %	70725007
156	NC_007168	ATT	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725007
157	NC_007168	GAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
158	NC_007168	TGA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
159	NC_007168	CGT	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
160	NC_007168	GAT	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
161	NC_007168	AGA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
162	NC_007168	GAA	2	6	8572	8577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
163	NC_007168	TCA	2	6	8585	8590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725007
164	NC_007168	ATA	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725007
165	NC_007168	GAA	2	6	8686	8691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
166	NC_007168	TTC	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725007
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168	NC_007168	GAT	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
169	NC_007168	TGAAGA	2	12	8886	8897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725007
170	NC_007168	AGA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725007
171	NC_007168	AATT	2	8	9011	9018	50 %	50 %	0 %	0 %	70725007
172	NC_007168	ATTA	2	8	9075	9082	50 %	50 %	0 %	0 %	70725007
173	NC_007168	CTG	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725007
174	NC_007168	GAT	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725007
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178	NC_007168	GTG	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725007
179	NC_007168	TAGAAG	2	12	9395	9406	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	70725007
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242	NC_007168	ACA	2	6	13762	13767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725010
243	NC_007168	TG	3	6	13796	13801	0 %	50 %	50 %	0 %	70725011
244	NC_007168	ATT	2	6	13816	13821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725011
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250	NC_007168	TCT	2	6	14078	14083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	70725011
251	NC_007168	TGAT	2	8	14446	14453	25 %	50 %	25 %	0 %	70725012
252	NC_007168	TTG	2	6	14500	14505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725012
253	NC_007168	GT	3	6	14508	14513	0 %	50 %	50 %	0 %	70725012
254	NC_007168	ATC	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725012
255	NC_007168	TGGT	2	8	14561	14568	0 %	50 %	50 %	0 %	70725012
256	NC_007168	GGT	2	6	14586	14591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725012
257	NC_007168	GA	3	6	14699	14704	50 %	0 %	50 %	0 %	70725012
258	NC_007168	TGG	2	6	14768	14773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725012
259	NC_007168	TA	3	6	14806	14811	50 %	50 %	0 %	0 %	70725012
260	NC_007168	CAA	2	6	14814	14819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725012
261	NC_007168	AGC	2	6	14846	14851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	70725012
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263	NC_007168	TGG	2	6	14915	14920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725012
264	NC_007168	AAG	2	6	14923	14928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725012
265	NC_007168	GTG	2	6	15009	15014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	70725012
266	NC_007168	TAA	2	6	15035	15040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725012
267	NC_007168	GAT	2	6	15129	15134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725012
268	NC_007168	GAT	2	6	15180	15185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725012
269	NC_007168	TTA	2	6	15186	15191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725012
270	NC_007168	GAT	2	6	15198	15203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725012
271	NC_007168	ATC	2	6	15235	15240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725012
272	NC_007168	ATG	2	6	15271	15276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725012
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274	NC_007168	CAA	2	6	15517	15522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	70725013
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280	NC_007168	ATT	2	6	15755	15760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	70725013
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288	NC_007168	TTAA	2	8	16026	16033	50 %	50 %	0 %	0 %	70725013
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292	NC_007168	GTT	2	6	16140	16145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	70725013
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302	NC_007168	TGA	2	6	16706	16711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725014
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310	NC_007168	GAA	2	6	17142	17147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	70725014
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332	NC_007168	GTA	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725014
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344	NC_007168	TTGAAG	2	12	18618	18629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	70725015
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389	NC_007168	CGT	3	9	21077	21085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	70725017
390	NC_007168	ATA	2	6	21090	21095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	70725017
391	NC_007168	ACT	2	6	21104	21109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	70725017
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